Μετά το πέρας του συμβολαίου της εταιρείας Sega με το Steam, η εταιρεία δεν ανανέωσε την σύμβασή της, με αποτέλεσμα το Alpha Protocol, να έχει αφαιρεθεί από το Steam και να επιστρέφει στην Obsidian Entertainment.
Σε περίπτωση που έχει αγορασθεί ήδη το παιχνίδι στη πλατφόρμα του Steam, δεν θα υπάρξει κανένα πρόβλημα. Σε περίπτωση όμως που δε το έχετε τότε πρέπει να βρεθούν άλλες λύσεις.